文章导读:
- 1、如何在ncbi上查找基因序列设计引物
- 2、怎样查找所要基因的引物序列
- 3、如何在pubmed中查引物
- 4、可以在网上查询ILP标记的引物信息吗
- 5、如何查基因引物的特异性,就是看我们的引物是不是对这个基因特异的,还是否存在于别的基因上?
如何在ncbi上查找基因序列设计引物
在NCBI主页上方search栏左边有一个database选择框,点击下拉三角形选择nucleotide(如图红框)在search栏输入基因名搜索即可。 以人的orc1基因为例, 在搜索结果中选择mRNA和complete cds序列的结果都可以,如下 点击进入序列文件查看详情,以...
怎样查找所要基因的引物序列
你先看看你引物序列是什么吧,如果是巢氏PCR的引物,很有可能一部分序列是不在靶基因中的。
即使是一般的PCR引物,也可以只有3'端的一部分序列与靶基因匹配即可。
如果你想验证,直接合成后PCR,然后测序,验证下是不是得到EGFR序列即可。
当然,你也可以根据EGFR基因自己设计引物,这个很容易。
如何在pubmed中查引物
可以在pubmed上找到你要的基因的编码区也就是cds,然后带入primer软件,软件帮你设计引物。
可以在网上查询ILP标记的引物信息吗
可以的。引物查询方法:一共有两种查询引物的方法,包括primerbank和primer3,当我们查到引物时,我们需要用Pubmed来验证。
1、Primerbank:用引物银行查询引物时,我们只需要输入引物的名称,种属。
2、将searchby修改为keyword。
3、将species修改为您所需要的种属,如mouse。
4、输入您所需查的基因的名字,如atg5。
5、点击submit。
如何查基因引物的特异性,就是看我们的引物是不是对这个基因特异的,还是否存在于别的基因上?
看你的引物是否落在别的基因上,类似于同源性blast。有两个方法可以来判断
1.NCBI工具_Primer-BLAST——NCBI的引物设计和特异性检验工具 NCBI工具_Primer-BLAST——NCBI的引物设计和特异性检验工具
2.ucsc 网站进行primer blast 。
文章导读:1、如何在ncbi上查找基因序列设计引物2、怎样查找所要基因的引物序列3、如何在pubmed中查引物4、可以在网上查询ILP标记的引物信息吗5、如何查基因引物的特异性,就是看我们的引物是不是对这个基因特异的,还是否